按照基础研究类、应用开发类、社会科学和文化艺术类、经营管理类等不同类别，专项资金分类对领军人才和创新团队进行资助，并根据项目领先程度、团队人才梯队结构、项目研发和人才培养前景等情况，给予领军人才5～30万不同额度的资助。对拥有自主知识产权、产学研结合项目成效显著、团队创新能力强、人才数量充足、梯次结构合理的，由领军人才领衔的创新团队，可以高于上限，进行特别资助。

专项资金主要用于领军人才及其团队的自身建设、国内外交流合作与研修培训、文献资料费用、处理知识产权事务、学术休假、改善工作、生活和医疗保健条件、解决特殊困难等方面。按照专项资金使用计划和用途，领军人才对资助经费拥有充分的自主支配权。

专项资助申请时间不受限制。上海市人事局每年将对资助申请组织两次评审。